在少年时期，朱耐根与祖父同住于北京，那里，他对皮黄腔的热爱得到了谭鑫培的真传。随后，他以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直并称为“南朱北王”，在京剧界享有盛名。著名票友陈小田在其作品《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音：“如浮云遮月”，他的声音媲美小余，更是技艺炉火纯青。
随着年纪的增长，朱耐根继续以票友的身份生活在上海。在那里，他被尊称为“耐二爷”并被视为票界的宗师。他精通谭派唱腔，并曾多次前往扬州和常州传授自己的技艺。在那里，与他结拜的宝应票友，如居佑申和郭季良，对他的教诲怀有深厚敬意，而后来许多宝应地区的人们学习京剧，也是受到了他影响的一部分。甚至他的夫人魏雅兰也是一位票友。
朱耐根留下的唱腔录音，由高亭和百代两家公司灌制成三张唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是由谭鑫培本人未灌录音，因此成为研究谭派声腔艺术珍贵资料至今保存于上海图书馆。
