在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传，并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地，以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名，他们共同被称为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提及谭派的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿曾经赞扬过朱氏的声音说：“如浮云遮月”，并且他的声音媲美小余，更是技术炉火纯青。
随着年纪的增长，朱耐根以票友身份定居于上海，在那里，他被尊称为“耐二爷”，并成为票界中的宗师。他精通谭派唱腔，并曾在扬州和常州传授技艺。宝应地区的票友们，如居佑申和郭季良，与朱氏结拜，有幸切磋技艺，从而获得了他的教益。在宝应地区学习京剧的人很多，这也归功于朱氏对京剧艺术的影响。而且，朱耐根夫人魏雅兰也是一个知名的票友。
三张由高亭和百代公司制作的情景唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作），这三张唱片因其独特的声音，对研究谭派声腔艺术来说，是极为珍贵的声音资料（这些唱片现存于上海图书馆）。
