二战结束后，美军一度计划焚毁靖国神社，但最终因冷战对策考虑而放弃。靖国神社作为美国人眼中的“刺”曾引发了广泛争议，自1941年日本偷袭珍珠港以来，美国开始研究日本军国主义的根源，并拍摄了一部名为《认识你的敌人日本》的电影，以解释日军的战斗精神和对靖国神社的崇拜。
随着战争接近尾声，美军将领麦克阿瑟在1945年8月15日抵达东京，将成为盟军最高司令官并开始统治日本。他下令解除武装、逮捕战犯，并实施宗教信仰自由政策。这一政策矛头直指靖国神社，因为它被视为极端国家主义和军国主义的象征。
然而，一些美军将领建议麦克阿瑟烧毁靖国神社，以彻底消除其精神影响力。但是在驻日美军中，有些人认为这样做太过严苛。最后，他们决定允许日本人举行大祭，并监控情况以确定如何处理这座神社。在大祭上，裕仁天皇及政府官员参加了，这是战败后的第一次也是最后一次国家主持的大祭。
尽管如此，在中国、苏联等外界强烈要求下，以及盟总发布新指令后，静态管理已不再承认转让给神社的土地。1951年9月，最终批准了土地转让事宜，使得靖国神社得以保留下来，但它仍然成为了右翼势力的招魂场所，为侵略战争翻案的一面镜子。
