二战结束后，美军一度计划焚毁靖国神社，但最终因冷战对策考虑而放弃。靖国神社曾是美国人眼中的一颗刺痊愈的疤痕，其历史深度触及了日本军国主义的根源。1941年12月7日，日本发动珍珠港偷袭，拉开了太平洋战争的大幕。在一系列战斗中，美国人亲身体验到了日军不畏牺牲的“战斗精神”，因此开始研究日本军国主义之谜。1945年，《认识你的敌人日本》影片揭示了天皇在日本民众心中的至高无上地位，以及他们相信战死后能被供奉于靖国神社。
随着美军占领东京和麦克阿瑟成为盟军最高司令官，对待靖国神社的态度转变。然而，一些美将坚持认为应彻底消除其作为国家主义象征的地位，因此提议烧毁这座神社。但是，这个建议未能实现，因为横井时常利用信教自由政策成功地让靖国神社从国家管理下脱离出来，并得以保留。
尽管如此，大祭依然举行并且得到允许，以此来展示日本人的忠诚与对亡灵的纪念。而麦克阿瑟发布的“神道指令”废除了国家宗教，但允许靖国神社成为一个宗教法人团体，从而逃过了灭顶之灾。此后的岁月里，虽然有多次尝试限制或改变它的地位，但最终靖国神社得以苟延残喘，最终成为了右翼势力为侵略招魂、翻案的一个舞台。
