在西元4世纪，罗马皇帝君士坦丁为纪念耶稣门徒圣伯多禄的殉道，在罗马城西北角建造了君士坦丁大教堂。15至16世纪，这座建筑物被改造成如今的圣伯多禄大殿，是天主教会举行重大仪式的地方。公元756年，法兰克王国国王丕平将罗马及其周围地区赠予教宗，从而成立了半世俗政体型态的“教宗国”，覆盖意大利半岛中部的大部分地区。
19世纪，欧洲民族主义兴起，意大利统一运动使得梵蒂冈失去了意大利领土。在这种背景下，拿破仑三世以“保护者”之名出兵保护罗马，但普法战争结束后，他撤军，使得意大利王国军队顺利占领罗马城，并完成了国家统一。随后，教宗退居梵蒂冈宫中，与新生的意大利王国关系紧张。
1929年，《拉特兰条约》签订，将梵蒂冈城定为独立主权国家，其领土神圣不可侵犯。这份协议解决了与意大利政府之间长期存在的问题。第二次世界大战期间，梵蒂冈保持中立，并由庇护十二世担任教宗。
近年来，对于《拉特兰条约》下的法律适用情况发生变动。在2009年1月1日前，由于不愿自动采纳过于繁琐且与天主教信仰相违背的法律，当地宣布停止这一做法。
关于梵蒂冈旗帜，它由两个面积相同的竖直方块组成，其中左侧是白色，上面印有红色的牧徽：两把交叉的钥匙和三重冠，这些元素象征着金、银和瑞士卫队帽徽颜色，以及历史上对红色在天主堂中的重要性。
梵蒂冈国徽则是保禄六世时期所使用的一个版本，其图案包括一个红色的皇冠和两把交叉状镶嵌着黄银色的钥匙。这代表了作为地球上的代表者的权力以及被赋予的地位，同时还引用了一句《马太福音》的内容：“我要把天国内部的一切钥匙给你”。
