在西元4世纪,罗马皇帝君士坦丁为纪念耶稣门徒圣伯多禄的殉道,在罗马城西北角建造了君士坦丁大教堂。15至16世纪,该建筑被改造成今日的圣伯多禄大殿,成为了天主教会举行重大仪式的地方。公元756年,法兰克王国国王丕平将罗马及其周围区域赠予教宗,这标志着“丕平献土”事件,并促成了半世俗政体型态的“教宗国”,其领土涵盖了意大利半岛中部的大部分地区。
19世纪末期,随着欧洲民族主义和意大利统一运动的兴起,梵蒂冈失去了在意大利境内的大片土地。1870年普法战争结束后,法国军队撤出罗马,使得意大利军队顺利占领该市,从而完成了意大利统一。此后,梵蒂冈宫成为教宗避难之地,而历届教宗均对新成立的意大利王国持敌视态度,不愿信徒参与国家事务。
1929年2月11日,《拉特兰条约》签署完成,此条约承认梵蒂冈作为主权国家,其领土包括位于罗马城西北角的小型独立城市国家——梵蒂冈城国。这份历史文件正式解决了圣座与 意大利政府之间长期存在的问题。第二次世界大战期间,梵蒂冈保持中立,其当时执掌位的是庇护十二世。
2009年1月1日,由于认为新的法律过于繁杂且与天主教义相悖,对未来采纳意大利议会通过法律表示放弃。此外,还有关于梵蒂冈国旗和国徽的情节描述。