在清代的历史长河中，统治者对农民起义的俘虏往往采取了极其残酷的手段，一般都是凌迟处死。太平天国北伐军失败后，被俘的将领林凤翔、李开芳等人，在押解至北京后遭到了凌迟示众的惨淡命运。而捻军首领张洛行、赖文光兵败被俘，以及太平天国忠王李秀成、英王陈玉成，都未能幸免于难，他们也都遭受了凌迟之刑。
翼王石达开在大渡河失利后向四川总督骆秉章投诚，但最终还是没有得到宽恕。清廷下令，将石达开不必押送北京，而是在四川就地处以凌迟之刑。在同治二年六月二十五日，清兵把石达开和宰辅曾仕和、中丞黄再忠等人绑赴刑场，执行凌迟时，刽子手先对曾仕和割第一刀，他痛苦地惨叫狂呼，而石达开斥责他说：“为什么不忍受此须臾时间？”曾仕和这才紧咬牙关，不再叫喊。
石达开受刑时，被割了一千多刀，他始终默然无声。这份凛然正气和坚强意志，使得清军官兵感到震惊。四川布政使刘蓉评价他：“枭桀坚强之气溢于颜面，而词句不亢不卑，不作摇尾乞怜语。临刑之际，神色怡然，实丑类之最悍者。”中国历史上，有许多皇帝死于非命，但被凌迟处死的人只有一个，那就是太平天国的幼天王洪天贵福。
洪天贵福是洪秀全长子的儿子，从1860年起即以幼天王名义发布诏旨。但1864年6月6日洪秀全去世后，即位称幼天王仅短短两个月，就在7月19日京城陷落之后突围至广德，最终在江西被捕并11月18日被凌迟处决。这次事件显示了当时社会对异端信仰的恐惧与压迫，同时也是中国近代史上的一次重大屠杀事件之一。
而对于太平军女兵，她们通常会受到更加残酷的地狱式折磨，比如骑木驴游街然后接受剖腹或其他种种酷刑，这些悲剧发生在1864年的秋收季节，当地习俗中有雇人割稻的香客活动，因为生怕自己身份暴露而化装为香客割稻，却因身份暴露而最终落入敌手，并遭遇悲惨死亡。此外，《华北先驱报》记录下了一封目睹这样的景象并写下的信件，其中详细描述了这些女士们如何因为年龄大小不同而接受不同的待遇，也包括婴儿被从母亲怀里夺走剖腹的情形，让人们感受到那时代空前的残忍与混乱。
