元代的军队体系十分复杂，包括蒙古军、探马赤军、汉军、新附军等不同组成。在漠北草原上，蒙古人依然维持着兵民合一的游牧生活，当战争爆发时他们便会集体出征，而平时则回归于牧业。对于在华北地区的蒙古人和金国降将以及被收编入元朝政权的人们，他们通常被登记为“军户”，即参与国家防御并承担一定的税务义务。
这段时间里，通过奥鲁管理的是蒙古、探马赤军和汉军中的士兵。奥鲁不仅负责征召当地年轻男子服役，还要确保这些服役人员得到所需的装备和补给。此外，它们还需要提供额外的人员以弥补因死亡或逃跑而导致缺员的情况。
至于新附军，这部分由南宋降将组成，但没有设立奥鲁进行管理。从组织结构来看，元代分为两大系统：一是京师（大都）的宿卫系统，由怯薛和侍卫亲王构成；二是镇守全国各地的镇戍系统。这两者分别由皇帝及其亲信直接指挥或行枢密院统领。
随着忽必烈建立起自己的政权，他保留了前任创立的一些制度，比如四怯薛轮番进入禁城侍奉，并且继续使用他们作为宫廷护卫。而侍卫亲王则用作保护京畿安全，其品级与万户相当，与枢密院有关联。
对于边疆地区，如华北、陕西以及四川等地，都由蒙古及探马赤之部队负责防守。而在南方，则有多种族群共同参与驻扎，其中临江沿淮区域尤其重要。最后，对于行省下属的武力部署，由行省本身负责日常事务，但调动更换防线等重大决策仍需经过枢密院审批，以保持整个帝国防御力量的一致性。
