明朝永乐元年，成祖派使者赴奴儿干招抚，次年各部归附。朝廷任命首领为指挥同知等职，以此为基础，在黑龙江、乌苏里江流域成立卫所。一百三十一个卫逐渐建立，永乐七年在忽剌修奴的建议下，在黑龙江入海口设立都指挥使司，以康旺为都指挥同知，王肇舟为指挥佥事。奴儿干，又称耦儿干、努而哥或纳尔干，是明朝在黑龙江下游设置的最高地方军政机构。这里风景如画，被清人称作尼噜罕。
明初洪武八年在东北南部设辽东都指挥司，使。在洪武二十八年周兴进军脑温江、忽刺温河和斡朵怜一带始建卫所制。永乐七年升奴儿干卫为都司，并驻地于奴儿干城。这一地区直隶中央政府，有钦差大臣定期巡视，对官员授予职位并赏赐。此外，还修建了永宁寺留有石碑记载其历史。
