内忧外患的双重打击
元朝在内政上出现了一系列问题，导致内部矛盾激化。首先，皇帝权力过于集中，导致官员之间的权力斗争频发。例如，忽必烈即位后，将自己的亲信分封至各地，这造成了地方官吏对中央政府的不满和反抗。此外，由于忽必烈等汗王对于蒙古习俗和汉族文化的融合不够深入，使得元朝无法有效地控制整个帝国。这一方面加剧了北方游牧民族与南方农业社会之间的冲突。
经济衰败与社会动荡
随着时间的推移，元朝经济也逐渐走向衰败。主要原因包括货币贬值、商业活动减少以及农民阶级受压迫。在这种背景下，一些地区爆发了农民起义，如红巾军起义，这些起义严重削弱了元朝中央集权体制，并且给予周边国家以借机进攻的机会。
军事力量削弱与边疆防御松懈
从军事上看，元朝在征服新领土时投入巨大的资源，但长期战争消耗了大量人力物力。此外，由于战略上的错误决策，如忽视对西域重要城市如 Samarqand 和 Balkh 的控制，以及对东亚海域（特别是日本）的海上封锁失败，都极大地削弱了其军事实力的同时，也为后来的侵略者打开了缺口。
传统文化与政治制度失效
虽然蒙古人的征服带来了新的文化交流，但这些新元素并未能够充分融入到现有的政治体系中。例如，对待非蒙古人群如汉族、回教徒等采取的是一种居住地政策，而不是真正意义上的同化政策，因此这些不同民族间存在深刻的问题。这使得 元朝难以建立一个稳固的人口基础，同时也影响到了它的一致性和凝聚力。
外来势力的挑战与国内改革无效
最后，在这个过程中，还有一种来自国外力量不断侵蚀着元代的心理安全感，比如成吉思汗之后继承人的内讧引发了一系列连环事件，使得当时及后续几十年都处于一种不安定的状态。而尝试进行改革，如设立文馆教授儒家经典，以此来提高士绅层次教育水平并增强国家凝聚力，却未能有效解决根本问题，最终还是被历史所淘汰。
