民族矛盾激化
元朝建立后，蒙古人对汉族实行严格的统治政策，使得民族关系日益紧张。蒙古贵族和官员往往对汉人采取苛刻的待遇，不仅经济上剥削，还在政治上排挤汉人。在军事上，蒙古骑兵优于汉军，这也加剧了民族矛盾。例如，在明初反蒙运动中，许多地方人民纷纷起义反抗元政府，这些事件不仅耗费了大量的人力物力，也削弱了中央集权。
财政危机
随着时间的推移，元朝开始出现财政问题。这主要是因为战争消耗巨大、税收政策不合理以及贪污腐败现象普遍。国家无法有效地控制开支和增加收入，因此常常不得不借钱或发行贬值银两来弥补赤字，这导致民众信心丧失，对政府失去支持。此外，由于长期战争和自然灾害等因素，农民负担重重，加剧了社会矛盾。
文化衰退与思想封闭
元朝虽然在科技艺术方面有所发展，但总体而言，其文化整体水平并未达到前代，而是在道德教化、文学艺术等方面出现了一定的衰退。此外，由于宗教信仰的影响，特别是佛教与道教被逐渐压制，与儒家学说相比变得较为冷落。而这种思想上的封闭使得新思想、新知识难以进入社会，从而限制了国家创新能力。
军事防御空虚
面对北方各少数民族如女真人的不断侵扰，以及南方明室复辟势力的威胁，元朝军队却缺乏有效应对策略。由于过度依赖武装力量解决问题，同时忽视内政建设，如教育、农业等基础工作，使得国家内部结构脆弱。当面临来自多个方向的挑战时，便显得无力抵抗，最终导致国土迅速缩小。
制度弊端深入蔓延
作为一个草原帝国转型成文明国家过程中的尝试，一系列新的行政体系和法律法规确立起来。但这些改革并没有彻底改变旧有的权力结构和生活方式，只是 поверх层次地进行了一些调整。在实际运行中，上述制度往往不能很好地适应不同的地区差异，更何况对于当时复杂多变的地形环境来说，是显然不足以满足需要的一种管理方式。因此，当遇到突发情况时，没有一套完善可靠的手段来应对，以致于各种问题积累至一定程度后爆发出来，最终促成了整个王朝的大崩溃。
