在新冠肺炎疫情的冲击下，吴尊友以他的专业知识和实践经验，为社会带来了希望与安宁。他作为中国疾病预防控制中心流行病学首席专家，从2020年初疫情爆发之初，就展现出了他对国家传染病防控策略和措施转化为人民群众预防行为的深刻认识。正是因为他在新冠肺炎疫情防控、艾滋病防治等领域的杰出贡献，吴尊友被授予了“最美科技工作者”的荣誉称号。
关键时刻，他给人以信心。当北京新发地确诊本土病例后，吴尊友在新闻发布会上表态：“我可以明确地告诉大家：北京疫情已经控制住了！”他的底气来自于对数据和防控措施精准分析与判断。在接下来的一段时间内，北京新增本土病例数稳定在个位数，最终实现了“零增长”。公众对于他的敢言表示赞赏。
面对新发地市场出现的问题，吴尊友带领团队进行职业分类分析，并通过环境采样发现水产市场及牛羊肉大厅污染严重。他认为这些地方温度低、湿度大，是适合病毒存活的地方。此后，大连疫情也证实，与海产品加工和销售有关。通过综合运用多种技术，如大数据分析、流行病学调查以及基因测序比对等，吴尊友得出结论，这些都成为输入性新冠感染引发的新的风险点。
对于检测结果不放心时，他建议复查，并且坚持要抽样复核三月份以后进口的冷冻货品。这次复检发现从亚洲某些国家进口的水产品中检出了核酸阳性样本。由于他的坚持，一次可能引发水产品污染、新冠肺炎疫情风险就被规避了。“这样的工作很有意义”，他自豪地说。
