二战结束后，美军一度计划焚毁靖国神社，但最终因冷战对策考虑而放弃。靖国神社曾是美国人眼中的一颗疼痛的钉子，自1941年日本偷袭珍珠港以来，美国开始研究日本军国主义的根源。1945年，美军拍摄了《认识你的敌人日本》，揭示天皇在日本人的心目中的至圣地位，以及他们相信战死后灵魂可供奉于靖国神社这一点。
随着麦克阿瑟将领的到来，他作为盟军最高司令官，将实施宗教信仰自由，并禁止极端国家主义和军国主义组织。此时，一些美军将领建议烧毁靖国神社，但这个提议未被采纳。横井时常利用信教自由政策，以纯宗教形式维护了静冈神社，而不是像原先那样由国家管理。
尽管如此，在战争遗孤和右翼势力的游说下，大祭还是得以举行。这一事件导致盟总发布“神道指令”，废止国家神道并实行政教分离，但同意靖国神社脱离国家管理成为宗教法人。在之后的一系列指令和谈判中，虽然靖国神社面临着合法性问题，但最终得以苟延残喘。
然而，这场争论背后的真相远不止表面的冲突所示。一份解密文件揭示了当年的决策背后真正动机：美国担心废除靖国 神 社会会可能引发更多事端，不利于其对日本占领政策的继续推进。在这种背景下，当时美国人的决定显然与现在人们对于此事件的理解有所出入。
