在西元4世纪，罗马皇帝君士坦丁为纪念耶稣门徒圣伯多禄的殉道，在罗马城西北角建造了君士坦丁大教堂。15至16世纪，该建筑被改造成今日的圣伯多禄大殿，成为了天主教举行盛大仪式的地方。公元756年，法兰克王国国王丕平将罗马及其周围区域赠予教宗，这一献土行动标志着教宗国的建立，其领土涵盖意大利半岛中部的大片地区。
19世纪，民族主义浪潮席卷欧洲，对梵蒂冈构成了威胁。在意大利统一运动中，萨丁尼亚王国扮演关键角色，最终促成了意大利王国成立。面对这一变化，拿破仑三世以“保护者”自居，为罗马城提供军事支持。但随着普法战争的爆发，他调回军队，使得意大利军队顺利占领罗马城，从而完成了国家统一。而教宗则迁至梵蒂冈宫中，不愿与新兴国家合作。
1929年，《拉特兰条约》签署后，意大利承认梵蒂冈为独立主权国家，其领地限定于梵蒂冈城，并确保其作为中立国的地位。此外，该条约解决了长期存在的双方纷争问题。在第二次世界大战期间，尽管保持中立，但梵蒂冈仍然受到冲突影响。
近代时期，一些法律变动引起了梵蒂冈方面的一些顾虑，他们认为这些法律与天主教信仰相悖，因此宣布不再自动接受意大利议会通过的法律。此外，还有关于旗帜和徽章设计的问题，其中包括黄白色的旗帜代表金银两种金属，以及红色象征着曾经在天主教堂中的重要性，而保禄六世徽章则融合了三重冠、钥匙和《马太福音》的元素，以体现其最高权力和圣彼得传说中的象征意义。
