在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，作为一名票友，他在上海、杭州、汉口和常州等地进行了无偿表演，与另一位票友王君并称“南朱北王”。著名的京剧艺术家陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到谭派的一些杰出人物，其中就包括了朱耐根。苏少卿曾经在《剧评》中高度赞扬了朱氏的声音，“如浮云遮月”，与小余相比，更是技艺炉火纯青。
随着年岁的增长，朱耐根以票友身份定居上海，在那里他被尊为“耐二爷”和票界的宗师。他精通谭派唱腔，并且曾多次前往扬州和常州教授这门艺术。宝应地区的票友们，如佑申和郭季良，与他结拜，有幸切磋技艺，从而获得了他的宝贵指导。在此之后，宝应地区对于学习京剧的人数众多，这也归功于朱氏对他们影响深远。此外，朱耐根的大夫人魏雅兰也是一位票友。
他的唱腔录音曾经由高亭公司和百代公司灌制成三张唱片，即《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些录音是在谭鑫培没有留下任何录音之前完成的，因此它们成为研究谭派声乐艺术极为珍贵的声音资料（现在这三张唱片保存在上海图书馆）。
