在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名的京剧评论家陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。
苏少卿在他的文章《剧评》中高度赞扬了朱耐根的声音，“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青”。当朱耐根年事较高之后，他作为票友生活在上海，那里的人们尊称他为“耐二爷”，并将他视为票界中的楷模。朱氏精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州教授这门艺术。与他结拜的宝应票友，如佑申和郭季良，他们经常与他交流技艺，并从中学到了不少。在宝应地区学习京剧的人数众多，这也正是因为受到了朱耐根的影响。值得一提的是，朱耐根的夫人魏雅兰也是一个票友。
他的唱腔被高亭和百代两家公司录制成三张唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（合作与夫人）以及《探母回令》（合作与陈小田）。由于谭鑫培没有录制过这些作品，所以这三张唱片成为研究谭派声腔艺术的一份珍贵资料（现在保存于上海图书馆）。
