在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传，并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地，以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名，他们共同被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提及谭派的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿曾经赞扬过朱耐根的声音，“如浮云遮月”，他的声音媲美于小余，而且他的传唱区别于苍劲，更是炉火纯青。
当年轻时已过，朱耐根以票友的身份定居上海，他被尊称为“耐二爷”，并被视为票界中的宗师。他精通谭派唱腔，并且曾在扬州和常州教授这门艺术。宝应地区的票友们，如佑申和郭季良，与朱氏结拜，为他们提供了学习机会。在那段时间里，他们不仅切磋技艺，还深受其教益。这也影响了后来的宝应研究京剧的人士。值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是位票友。
三张由高亭和百代公司制作的唱片，是对朱耐根唱腔最好的记录。这包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是首次录制谭鑫培风格，所以它们成为了研究谭派声腔艺术珍贵资料至今，这些珍贵的声音依然保存在上海图书馆。
