在少年时光中,朱耐根跟随祖父居住于北京,那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传,并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地,以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名,他们共同被称为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提及谭派的杰出人物,朱耐根就是其中之一。苏少卿在《剧评》一文中赞扬了朱氏的声音“如浮云遮月”,并指出其声音之美媚不输小余,同时声色更显苍劲有力,炉火纯青。
随着年龄的增长,朱耐根以票友身份定居上海,在当地被尊称为“耐二爷”,并且是票界的一位宗师。他精通谭派唱腔,并曾在扬州和常州教授这门艺术。宝应地区的票友,如居佑申和郭季良,与他结拜,他们经常与之切磋技艺,从而受益匪浅。在宝应地区学习京剧的人数众多,这也归功于朱氏对这一艺术形式所做出的贡献。而他的夫人魏雅兰,也是一位值得尊敬的票友。
三张由高亭和百代公司制作的唱片,其中包括《法场换子》、《梅龙镇》(与夫人合作)以及《探母回令》(与陈小田合作),这些唱片是研究谭派声腔艺术极为珍贵的声音资料。这三张唱片至今仍然保存在上海图书馆,为后人研究提供了宝贵资源。