在新冠肺炎疫情的冲击下，吴尊友以他的专业知识和深厚的研究背景，成为了一名抗疫战场上的重要力量。他作为中国疾病预防控制中心流行病学首席专家，在关键时刻总能提供科学依据和精准分析，为社会带来信心。他的工作不仅涉及新冠肺炎的防控，还包括艾滋病等其他传染病的研究与管理。
他曾在2020年6月18日的一次新闻发布会上，对北京新发地疫情表示“已经控制住了”，这一言论震惊四方。实际上，他之前也对北京的情况充满了担忧，但最终基于对数据和防控措施的精确分析，他得出了积极结论。在接下来的一周内，北京确实实现了连续多天零新增本土感染者，最终实现了“零增长”。
随着时间推移，当新的疑点出现，比如为什么是新发地市场，以及源头如何，这些问题都被吴尊友带领的小组彻底探究。他利用职业分类、环境采样以及大数据分析技术等手段，揭示出水产市场可能是爆发点，并且这些环境适合病毒存活，从而导致其传播风险。
在决定重新开放冷库货品到市时，吴尊友建议进行额外检测，以确保安全性。这一次复检发现从亚洲某些国家进口的水产品中有阳性样本，因此这批货物最终未能投放市场。吴尊友对此结果感到满意，因为这样做规避了一次潜在的大规模疫情风险。他认为这样的工作非常有意义，因为它保护了公众健康，同时也是他个人的专业追求。
