《天工开物》之所以在明朝时期被列为禁书，其原因多层次且复杂。首先，明朝是一个封建社会，对于异端邪说极其敏感。宋应星的这部杰作中，不仅涉及了与当时官方观点相悖的自然现象解释，还包括了一些对农业生产有改进性的新理论和实践，这些内容被视为“异端邪说”，因此遭到了禁令。此外，明代实行科举制度，官员们必须通过考试才能晋升。然而，《天工开物》的某些观点和理论对于那些追求官位的人来说是有威胁的，因为这些思想可能会影响他们的立场和利益，从而引发不必要的麻烦。
此外，在那个时代，儒家思想占据主导地位，“天命论”和“君权神授”的概念深入人心，而《天工开物》中的科技创新理念似乎挑战了这种宇宙观念，使其看起来与传统价值观背道而驰。这导致该书中的许多内容都被视为“异端邪说”，最终遭到了禁止。
最后，由于文化交流有限，对于来自欧洲机械学、天文学等领域的新知识持谨慎态度也是一个重要因素。这些外来技术虽然在今天看来是宝贵的科学成果，但在当时，却因为与传统文化差异过大，被认为是不合适甚至是不安全的事物，因此也成了禁止出版的一项理由。
综上所述，《天工开物》被列为禁书，有着多方面复杂原因：它挑战了当时官方思想；它可能威胁到官员们的地位利益；它违反了儒家思想；以及它包含了来自其他文化背景下的新的科学发现。尽管现在已经不是那个时代，但是《天工开物》依然是一本珍贵且富含启示意义的历史文献，它揭示了人类智慧如何跨越时间界限，为我们提供了解古代科技发展的一个窗口。
