在西元4世纪，罗马皇帝君士坦丁为纪念耶稣门徒圣伯多禄的殉道，于罗马城西北角建立了君士坦丁大教堂。到了15至16世纪，这座教堂被改建成如今的圣伯多禄大殿，是天主教会举行重大仪式的地方。公元756年，法兰克王国国王丕平将罗马城及其周围区域赠予教宗，使得教廷成立了半世俗政体型态的“教宗国”，涵盖意大利半岛中部的大部分地区。
19世纪，欧洲民族主义兴起，意大利民族统一运动使得梵蒂冈面临领土缩小。在这背景下，拿破仑三世出兵保护罗马城，但随着普法战争结束，他撤军，让意大利军队顺利占领罗马市。1870年之后，梵蒂冈退居梵蒂冈宫，并且与意大利政府保持敌对关系。
1929年，《拉特兰条约》签订后，梵蒂冈成为主权国家，其领土包括位于罗马城中的梵蒂冈城国。这份协议解决了长期来的纷争，并确立了 梵蒂冈作为中立国家的地位。在第二次世界大战期间，它继续保持中立。当时的教宗是庇护十二世。
2009年1月1日，由于认为意大利法律过于繁杂和不符合天主教信仰原则，对未来采纳意大利议会通过法律表示放弃。此外，还有关于梵蒂冈旗帜和国徽的描述，以及它们象征意义和历史渊源。
